Сеченовский Университет: Онкофьюжн Онкодиагностическая платформа для борьбы с агрессивными опухолями

Основные статьи:

• Лабораторные информационные системы (ЛИС, LIS)
• Диагностика рака

2025: Анонс разработки онкодиагностической платформы для борьбы с агрессивными опухолями

Ученые Института персонализированной онкологии Первого МГМУ имени И.М. Сеченова работают над созданием мультиомиксной онкодиагностической платформы следующего поколения «Онкофьюжн», включающей в себя программное обеспечение и набор реагентов для лабораторной диагностики. С ее помощью можно будет определять геномные перестройки в опухоли в одном тесте, используя при этом минимальное количество опухолевого материала. Полученные данные помогут врачам подбирать пациентам с наиболее агрессивными злокачественными новообразованиями максимально эффективное персонализированное лечение. Над созданием платформы ученые Сеченовского Университета работают совместно с индустриальным партнером компанией «Онкобокс» – ведущим разработчиком в области молекулярной биологии и персонализированной медицины. Об этом 20 марта 2025 года сообщили представители Сеченовского Университета.

𝓲

Фото: DC Studio на Freepik

Как сообщалось, разрабатываемая онкодиагностическая платформа позволяет выявлять в опухолевых образцах так называемые химерные онкогены, возникающие из-за геномных перестроек в опухоли. Такие гибриды образуются путем слияния двух исходных генов. Некоторые из химерных генов провоцируют активный рост опухоли и против них уже созданы молекулярно нацеленные лекарства. В солидных (плотных) опухолях химерные онкогены образуются, например, с участием генов ALK, NTRK, MET, RET, ROS1 и других.

На март 2025 года для их обнаружения применяют методы иммуногистохимии, флуоресцентной гибридизации, полимеразной цепной реакции и другие техники. Но каждая из них имеет свои ограничения: низкую чувствительность и неспособность отличать значимые мутации от случайных. Отличительная особенность подхода ученых Сеченовского Университета – определение всех геномных перестроек в одном тесте. Для этого они будут использовать метод направленного секвенирования РНК.

Наша онкодиагностическая платформа будет выявлять перестройки генов ALK, FGFR, MET, NTRK, RET, ROS1. Такие перестройки встречаются практически во всех типах опухолей, хотя и крайне редко. Их своевременная детекция очень важна, поскольку при наличии таких перестроек опухоль особенно агрессивна. При этом для каждой из них уже разработаны специфические противоопухолевые препараты. Их применение в таких случаях часто дает «эффект Лазаря», когда заболевание полностью или почти полностью отступает, даже на поздних стадиях. рассказал Антон Буздин, руководитель проекта, главный научный сотрудник Института персонализированной онкологии Первого МГМУ, профессор РАН

Особенность платформы «Онкофьюжн» в том, что все онкогенные перестройки можно будет определять в одном тесте, используя при этом минимальное количество опухолевого материала. Это важная возможность, поскольку объем материала может быть сильно ограничен и необходимо, чтобы его хватило на все необходимые исследования. Кроме того, разработчики поставили перед собой задачу сделать создаваемую технологию максимально доступной для пациентов – тогда ее смогут использовать большее количество людей с онкозаболеваниями.

На март 2025 года день уже создан общий экспериментальный дизайн платформы и детально проработана технология выявления нескольких из заявленных генов. Разработку прототипа платформы планируется завершить в 2026 году. Проект реализуется в рамках программы стратегического академического лидерства «Приоритет-2030».